充質干細胞是組織的建造者和功能維持者：在組織形態發生中負責搭建腳手架，分化出骨骼、軟骨、脂肪、纖維等結締組織，構成器官發育框架結構；而且，間充質干細胞可以分泌數十種因子，為各種分化細胞提供所需營養。其基本特性包括：
 

　　

　　1、強大的增殖能力和多向分化潛能：

　　

　　在適宜的體內或體外環境下分化為成骨細胞、軟骨細胞、脂肪細胞、肌細胞、神經細胞、肝細胞、內皮細胞、基質細胞等多種細胞的能力。

　　

　　2、免疫調節功能：

　　

　　通過細胞間的相互作用及產生細胞因子干擾樹突狀細胞功能并抑制T細胞的增殖及其免疫反應，從而發揮免疫重建的功能。

　　

　　3、來源多樣：

　　

　　取材方便，易于分離、培養、擴增和純化，多次傳代擴增后仍具有干細胞特性。

　　

　　4、組織支持的“土壤細胞”

　　

　　充質干細胞是一種滋養層細胞，可能存在于所有組織中，支持多種細胞的生存和生長，包括：造血細胞、胚胎干細胞、腫瘤細胞、神經細胞、肝細胞、內皮細胞等。

　　

　　5、組織修復的“微藥廠”

　　

　　干細胞在體內發生炎癥損傷，釋放出炎癥信號時，持續地分泌相關抗炎性分子、抗凋亡分子等，在體內形成一個促進組織修復及再生的微環境。

　　

　　6、信號開關功能

　　

　　充質干細胞可能具有自身開/關調控機制，而這個調控機制的關鍵可能在于體內是否存在有炎癥信號。